Buona parte della nascita e dello sviluppo dei centri abitati nell´area milanese va fatta coincidere con il propagarsi del Cristianesimo che, con i suoi profondi legami religiosi e civili, ha reso possibile la formazione di insediamenti stabili e solidali tra le popolazioni native e immigrate. Tra questi centri vi è anche Gorgonzola, posta lungo l´antica strada romana per Aquileia, divenuta poi la Postale veneta.
Sull´origine del nome esistono varie ipotesi quasi tutte verosimili ma nessuna che si possa assumere come definitiva. I documenti certi sono, per ora, del 953 quando un Ambrogio notaio è detto chierico e custode della Chiesa di san Protaso in Gorgontiola; va aggiunto il contratto rilevato dallo storico Giulini che, nel 970, parla di un chierico Adalberto della chiesa di san Gervaso e Protaso in Gorgontiola. Altri studi ed ipotesi parlano del nome Argentia (nome di una località romana a 14 miglia sulla strada da Milano verso Bergamo, sulla strada che portava i pellegrini a Gerusalemme) che nei secoli divenne Gorgonzola.
A prescindere dalle numerosi varianti fonetiche prodotte dalle più svariate storpiature non lombarde, e persino milanesi, l’origine del nome Gorgonzola è stata fatta risalire per molto tempo al derivato latino Curte Argentia. Secondo alcune interpretazioni storiche, il nome indica un insediamento limitrofo alla più grande città romana di Argentia, tra Milano e Bergamo; per altri era Mutatio Argentia, una località romana che era una stazione di ristoro dove avveniva il cambio dei cavalli sulla strada verso Bergamo, al 14° miglio. Nei secoli il nome si sarebbe modificato in Curtis Argentia, piccolo villaggio vicino alla città romana Argentia, luogo di dominio di potenti signori. Nel Medioevo il suo nome si trasformò in Cort Argentiola, poi Cort Giuntiola ed infine in Gorgonzola. Di recente anche un’altra ipotesi si è fatta strada, ovvero la derivazione dalla dea romana Concordia, mutata poi in Corcondiola e appunto in Gorgonzola.
Gorgonzola era pure il capo della Pieve Ecclesiastica di una grande zona che arrivava fino a Segrate, ed era l´unica chiesa che aveva il diritto di battezzare, sposare e cresimare tutte le persone che vivevano nella Pieve.